El informe de las Naciones Unidas evaluó como justas y adecuadas las medidas adoptadas por Israel, aunque acusa al país de haber realizado un excesivo uso de la fuerza. Asimismo, el informe establece que "toda misión humanitaria destinada a la población de Gaza debe efectuarse por medio de los procedimientos establecidos a través de los puestos fronterizos terrestres designados para ello y en acuerdo con el Gobierno de Israel y la Autoridad Palestina".
En este contexto, el Embajador del Estado de Israel en la Argentina, Daniel Gazit manifestó que "Israel lamenta la muerte de los integrantes de la Flotilla, pero no se puede juzgar la reacción de los soldados cuando su vida está en peligro como en este caso. Ahora es evidente que los activistas no eran pacifistas y tampoco llevaban ayuda humanitaria".